世界樹に女神の果実が実るとき、
天の箱舟が降り立ち、
神の国への道が開かれる――
人間界のはるか
上空にある天使界には、
そんな言い伝えがありました。
天使たちは世界樹を育てるために、
人間の感謝の結晶である
星のオーラを集め、
世界樹に捧げ続けています。
そして、今まさにそのときが
訪れようとしていました……。
天使と人間たちが織りなす壮大な物語が、
いよいよ幕を開けるのです。
取扱説明書2ページの「ストーリー」より
ニンテンドーDSシリーズ本体（ニンテンドー3DS含む）に「ドラゴンクエストIX 星空の守り人」のDSカードをセットして電源を入れる。 すると、「警告-健康と安全のために」が表示されるので、画面をタッチするか何らかのボタンを押して進んでいこう。 本体のメニュー画面で「DRAGON QUEST IX ほしぞらのまもりびと SQUARE ENIX」をタッチするかAボタンを押して決定しよう （ニンテンドーDS/DS Lite本体の場合、起動モードをオートモードに設定しているとこの操作は不要となる）。
スクウェア・エニックスロゴやら何やらが表示されるので、再び何らかのボタンを押して進んでいこう。 その内、以下のような冒険の書の画面に移る。
| ぼうけんのしょをつくる Ｗｉ−Ｆｉせっていをする |
| ぼうけんをする ぼうけんのしょをＷｉ−Ｆｉつうしんでおくる ぼうけんのしょのカギをかくにんする ぼうけんのしょをけす Ｗｉ−Ｆｉせっていをする |
新しく冒険の書を作り、初めからプレイする
ニンテンドーWi-Fiコネクションの設定をする
冒険の書を選び、続きからプレイする
Wi-Fi通信により冒険の書をスクウェア・エニックスに送る
冒険の書が消えるわけではなく、冒険の内容を教えるものである（今となっては無意味）
冒険の書を送った後にもらえるナンバー
携帯サイト「星空の仲間たち」を利用するために必要（今となっては無意味）
冒険の書を選び、削除する
初めてゲームをプレイする場合は「ぼうけんのしょをつくる」を選択する。 冒険の書は1つのDSカードに、1つだけ作ることができる。 この後、主人公の名前入力に移る。名前は最大5文字となっている。
名前を入力し終わったら、いよいよあなたの冒険の始まりだ！
あなたの冒険はとても一日なんかじゃ終わらない。 一度、冒険を終わるには町の教会にいる神父、またはシスターと話し、「おいのりをする」を選んで冒険の書に記録してもらおう。 次回冒険を始める時は、冒険の書の画面で「ぼうけんをする」を選ぶ。 すると、冒険の書を記録した時の状態で、続きから冒険を始めることができるぞ。
また、中断の書に記録して終える方法もある。 移動中にメインコマンドの「さくせん」から「ちゅうだん」を選ぶと、中断の書に記録することができるぞ。 冒険の書とは異なり、1つしか記録することができない上、一度ロードすると消えてしまうという特性がある。 さらに中断データがある場合は冒険の書からの再開はできないのも注意。 しかしどこでも記録ができるので、緊急時には大変役に立つ。
ボタン操作の説明
| ボタン | 移動中 | メインコマンド | 戦闘中 |
|---|---|---|---|
| 方向キー | ・任意の方向へキャラを移動 ・Bボタンと同時押しで「しぐさ」実行 | ・カーソルの移動 | ・カーソルの移動 |
| Aボタン | ・アイコン表示時に押すと調べる、会話する、扉を開く、井戸に入る | ・コマンドの決定 | ・コマンドの決定 |
| Bボタン | ・「しぐさ」コマンドを出す ・アップで表示する | ・キャンセル | ・キャンセル |
| Xボタン | ・メインコマンドを開く | ・コマンドの決定 | ・コマンドの決定 |
| Yボタン | ・「これまでの おはなし」を見る | ・メインコマンドを閉じる | ・キャンセル |
| Lボタン | ・視点を最大90度左に回転 | ・コマンドの決定 | ・コマンドの決定 |
| Rボタン | ・視点を最大90度右に回転 | − | − |
| START | − | − | − |
| SELECT | ・「せんれき」を見る | ・アイテムリストの並び替え | − |
※LボタンとRボタン同時押しで元の視点に戻す
また、上記の操作はタッチペンを用いてもほとんど実行できる。この操作は全てタッチスクリーン（下画面）で行う。
・任意の方向へキャラを移動
画面のどこかにタッチした後、スライドすると矢印ができる。その方向へキャラが移動する。
・調べる、会話する、扉を開く、井戸に入る
表示されているアイコンをタッチすると実行する。
・メインコマンドを開く
画面右上にある羽のマークをタッチする。
このマークはスライドにより任意の位置に移動できる。
・コマンドの決定
コマンドをタッチすると緑色に変わり、もう一度タッチするとコマンドを決定する。
・キャンセル
メインコマンドの外をタッチするとキャンセルとなる。
・ページ送り
ウィンドウの下の矢印をタッチするとページが変わる。
移動中にXボタンを押すと出てくるメインコマンドの説明
| どうぐ じゅもん そうび せんれき つよさ さくせん |
装備品以外のアイテムを使用、確認する／「つかうもの」「だいじなもの」「たからのちず」から選ぶ／
「つかうもの」の場合はキャラか「ふくろ」「どうぐせいり」の3つに分かれる／
キャラの場合はアイテムを選ぶと以下の4つに分かれる
「つかう」…アイテムを使用する
「わたす」…アイテムを他のキャラに渡す（自分を選ぶとアイテムの並び替えができる）
「すてる」…アイテムを投げ捨てる
「やめる」…キャンセル／Bボタンと同じ
「ふくろ」の場合はアイテムを選ぶと以下の4つに分かれる
「つかう」…「ふくろ」のアイテムを使用する
「わたす」…「ふくろ」のアイテムを取り出し、キャラに渡す
「すてる」…「ふくろ」のアイテムを捨てる
「やめる」…キャンセル／Bボタンと同じ
※SERECTボタンで袋の中身を「しゅべつ順」か「あいうえお順」に並び替える
「どうぐせいり」…全員、または1人の秘伝書以外のアイテムを「ふくろ」に入れる
「だいじなもの」の場合、重要アイテムの確認のみできる
「たからのちず」の場合、任意の地図を選ぶと以下の2つに分かれる
「地図の場所をさがす」…その洞くつを探す場合に選択（選択しないと洞くつは見つからない）
「すてる」…宝の地図を丸めて投げ捨てる
装備品に分類されるアイテムを確認する／装備を変更する
※Yボタンでキャラの切り替え、LRでキャラを回転できる
個々の詳細パラメータ、呪文、特技を確認する
「ぜんいん」…全員のHP、最大HP、MP、最大MP、職業、Lv、攻撃力、攻撃力、素早さの一覧
「ぼうけんした時間」「しょじきん」「ぎんこう」「あずけた ちいさなメダル」も確認
移動中に使える呪文、特技を使用、確認する
「せんれき」を見る
「まんたん」…呪文を使って自動的にHPを全回復する
「さくせんがえ」…作戦、配置、イメージカラーを変更する
「スキルふりわけ」…スキルの確認、及びスキルポイントの振り分けをする
「しぐさ とうろく」…Bボタンで呼び出す「しぐさ」を設定する
「プロフィールせってい」…自分のプロフィールを設定する
「ボリュームせってい」…BGMと効果音の音量を設定する
「ちゅうだん」…中断の書に記録して冒険を終える
戦闘になると出てくる最初の戦闘コマンドの説明
| たたかう しらべる にげる さくせん |
敵と戦う時に選ぶコマンド／戦闘コマンド2で主人公の行動を決めた後、仲間が作戦に従って行動する
「めいれいさせろ」の場合、主人公と同様に仲間にも細かな指示を与える
モンスターの状態を調べる（不意打ち状態かどうか、テンションの有無など）
戦闘から逃げ出す／失敗した場合、ほとんどの敵に攻撃される
「さくせんがえ」…全員、または1人の作戦の変更をする
「そうびがえ」…装備している武器を変更する
「はいちがえ」…前列と後列を入れ替える
戦闘コマンド1入力後に出てくる戦闘コマンドの説明
| こうげき とくぎ じゅもん どうぐ ぼうぎょ ひっさつ |
装備している武器（または素手）で指定した敵を攻撃する
戦闘中に使える呪文を使用、確認する
自分の受けるダメージを半減する
戦闘中に使える特技を使用、確認する
装備品や手持ちのアイテムを使用、確認する
職業ごとに設定された必殺技を使用する／必殺チャージ後のみ使用できるコマンド
メインコマンドの「つよさ」の説明
| つよさ | 説明 | 最大値 |
|---|---|---|
| HP | 現在のHP（ヒットポイント）の値／敵の攻撃でダメージを受けると減っていき、0になると死んでしまう | 999 |
| MP | 現在のMP（マジックパワー）の値／呪文を唱えるたびに任意の値が減っていき、MPが足りなくなると、呪文が唱えられなくなる | 999 |
| G | 現在所持しているゴールドの値／アイテムを買う時に必要な、いわゆるお金／敵を倒して入手する他、宝箱の中にあることも | 9999999 |
| （名前） | キャラクターの名前を表す | − |
| （性別） | 性別を表す | − |
| （職業）+ | 現在の職業を表す／+値は転生回数で、★は10回以上を表す | − |
| Lv（レベル） | 総合的な強さを表す／レベルアップ時は能力値が全体的に上昇する／呪文を覚えることもある／スキルポイントを獲得できることがある | 99 |
| （装備） | 装備している武具を表す | − |
| Ex | 手に入れた経験値の累計を表す／敵を倒して戦闘に勝利すると数値が増え、一定の値に達するとレベルが上がる | 5238315 |
| （スキル） | その職業の5つのスキルと現在のポイントを表す | − |
| ちから | 「こうげき力」に影響 | 999 |
| すばやさ | 戦闘での行動順に影響／身かわし率に影響 | 999 |
| みのまもり | 「しゅび力」に影響 | 999 |
| きようさ | 会心の一撃の出やすさ、逃げやすさ、先制攻撃のしやすさ、アイテムの盗みやすさに影響 | 999 |
| みりょく | 「おしゃれさ」に影響 | 999 |
| かいふく魔力 | 回復呪文の回復量に影響 | 999 |
| こうげき魔力 | 攻撃呪文の威力に影響 | 999 |
| さいだいHP | HP（ヒットポイント）の最大値 | 999 |
| さいだいMP | MP（マジックパワー）の最大値 | 999 |
| こうげき力 | 武器の攻撃力＋「ちから」の値／「こうげき」コマンドやほとんどの特技で敵に与えるダメージに影響 | 999 |
| しゅび力 | 防具の守備力＋「みのまもり」の値／敵から受けるダメージに影響／呪文などの特殊攻撃は、この値に影響されない | 999 |
| おしゃれさ | 「みりょく」＋装備品による補正の値／高いほど敵が見とれやすくなる | 999 |
※「HP」「MP」は実際には「つよさ」ではなく、メインコマンドを開いた時の上画面の下に常時表示される。 「G」は実際には「つよさ」ではなく、メインコマンドを開いた時の下画面の右下に常時表示される